Si bien se trata de una disciplina que aporta a la salud total del individuo, su nacimiento hace que se la relacione sólo con las instituciones escolares.

A fines del siglo XIX, con la expansión de los sistemas educativos y el surgimiento de la Psicología Evolutiva, crece el interés por buscar soluciones a los problemas planteados en las escuelas. En las primeras décadas del siglo XX nos encontramos con la Psicología Educacional como una de las especialidades de la Psicología. Su tarea era la de detectar, diagnosticar y tratar alumnos con problemas de ajuste, comportamiento y aprendizaje.

La Psicopedagogía surge en un primer momento como una respuesta a la demanda planteada por la escuela, relacionada con las dificultades del aprendizaje dadas en ese ámbito escolar. Posteriormente, el Psicopedagogo atiende la salud mental del alumno, teniendo en cuenta los aspectos afectivos, emocionales y relacionales; la orientación pasa a ser esencialmente clínica.

En un tercer momento se acentúan los aspectos comunitarios y las intervenciones estructurales, en detrimento de las intervenciones individuales. La postura es que los casos individuales no pueden ser tratados independientemente del ámbito educativo en que se manifiestan.

A mitad del siglo XX la Psicopedagogía fue reconocida como una disciplina científica. Se estructuró su enseñanza a nivel universitario y ocupó así el lugar de la Psicología Educacional.