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La alta frecuencia de infecciones perinatales pueden ser prevenidas en gran medida, según especialistas en infectología. Transmisión vertical del HIV, sífilis congénita, herpes, sepsis neonatal, etc. pueden ser prevenidas, reduciendo la mortalidad que provocan en recién nacidos. Sin embargo, esto no es posible si los servicios de neonatología no incorporan normas más exigentes y no se adecuan los tratamientos a las nuevas recomendaciones terapéuticas. Existen protocolos siempre mejorados para la prevención, por ejemplo, de la transmisión del HIV de madres infectadas a sus bebés, tanto durante el embarazo como en el momento del parto y la lactancia. El índice de transmisión desciende del 30% al 1-5%, dependiendo del cumplimiento estricto de dichas recomendaciones. En el caso de la sepsis, puede provenir de microorganismos vivientes en el canal de parto, pero también de agentes nosocomiales, por lo cual una adecuada asepsia hospitalaria puede hacer descender su incidencia en recién nacidos. Según estudios recientes, la infección por el virus herpes simplex puede ser reducida a menos de la mitad de los casos solamente con la modificación de la dosis de antiviral normalmente usado (acyclovir), lo cual demuestra que una constante actualización de los profesionales médicos también contribuirá a mejorar el pronóstico. Otra de las recomendaciones de los expertos es incentivar las acciones preventivas en la población, ya que muchas de las enfermedades que pueden padecer los bebés podrían haber sido prevenidas en sus mamás, como la sífilis.
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Una causa de parto prematuro suelen ser las infecciones, causadas por distintos agentes infecciosos.
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